交通部民用航空局於７月１６日表示，國內縣航空機票將於明（２０１４）年１月１日起，分３階段調漲，調幅從５％到２０％。民航局強調，為避免給民眾造成太大的負擔，會以政府、業者和民眾各分攤一部分的方式進行，民航局也表示：除了４月召開公聽會廣納各方意見外，也就日後調整票價時的可能配套方案預先研議，希望可以降低新票價實施的衝擊。
由於國內航空票價已８年未調整，期間油價漲了１倍以上，國內航線又未比照國際航線，可隨油價收取燃油附加費，因此，交通部及民航局皆支持國內航空票價應合理反映油價成本，此外，民航局也決定取消國內航線每年約新台幣２億元的降落費，減輕業者成本外，也研擬用民航作業基金，增加對離島居民的票價補貼。
民航局已向交通部提報國內航線票價調漲方案，２４條國內航線票價，不論是離島或本島航線的票價，都將在明年１月１日起調整，依據民航局的「國內航空票價調漲方案」，初步規劃以高雄─馬公、金門─馬公航線調高５％，台北─花蓮、台北─台東調漲約１０％，台北─金門最高漲２０％，價格將從２２２０元，漲至２６６４元。針對漲幅較低的航線會一次漲足，漲幅較高的則是在１年內分３個階段調漲，但民航局目前不願透露３階段調漲的時間點。
