東京媽祖廟在農曆五月五日，陽曆六月十八日早上舉行端午節祭拜儀式，當天不是國定假日，仍有十幾名信徒前來參拜，媽祖廟也利用中午取午時水祭拜太陽星君，提供信徒將午時水帶回家灑淨，除障，去穢。
今年端午節雖不是假日，媽祖廟仍照習俗準備端午祭拜，信徒提前到廟裡包粽子，做好的葷素粽，祭拜媽祖兵將及各殿神明。因為許多信徒為家庭子女問題前來求媽祖指示，媽祖廟代表連昭惠說，媽祖慈悲，希望眾生都能得到救贖，不過在這之前，個人有個人的業障需要消除，所以媽祖會給每個人不同的功課，如果照指示，將功課做好做滿，就能感受到改變。
團拜之後，將近午時，大家來到媽祖廟庭院接午時水，今年端午，東京天候不佳，不過中午太陽稍稍露臉，端午的太陽有驅邪健體的效能，把握時間接陽氣，讓這一年身體健康，精氣神暢旺。在誦經之後，一起享用廟裡的素齋，及端午粽子，下午是為一些完成誦經功課的信徒，向媽祖呈報疏文，為了家人父母子女的平安，每日不間斷的修持，固定完成媽祖交代的功課，提升自己，也能看到家人的越來越好的進步。
今年東京的端午節雖然不像節氣中說的暑熱，也沒有划龍舟活動，但海外僑胞儘量依節氣行事，遵照傳統，日本也有五月菖浦的習俗，夏季，正是疾病開始流行的季節，因此端午可追溯為驅邪避惡，以求身心的平安。由現代的眼光看來，在初夏蟲疫滋生之際，提醒大家做好保健的工作，延續先人的智慧，現代人也應依時節防疫保健，維護健康。
